I “Ekorrarnas krig” möter vi Valtteri och Pekka som är både bröder och grannar. De bor i varsitt träd och under hösten samlar de kottar för att klara av vintern. Valtteris stora träd ger många kottar, medan Pekkas lilla träd ger endast lite mat. När vintern kommer börjar bröderna bråka och snart är kriget ett faktum. Hur ska det gå för bröderna och för alla andra i skogen?